LMAI.Bio.生产的PBCV-1 DNA Ligase,即PBCV-1 DNA连接酶,也被称为PBCV DNA Ligase、SplintR连接酶或Chorella virus DNA连接酶,是一种ATP依赖的DNA连接酶,能够高效催化与一条互补的RNA单链配对的两条相邻DNA单链的连接反应。这两条相邻的DNA链中,提供3'羟基的被称之为受体DNA链(Acceptor DNA),提供5'磷酸的被称之为供体DNA链(Donor DNA);在这个连接过程中需要一条互补的RNA链对两条DNA单链起“夹板”或“支架”的作用。
PBCV-1 DNA Ligase在连接点处可以耐受多种碱基对的组合,但当5'端磷酸化的Donor DNA与“夹板”RNA所形成的第一个碱基对是dC/G和dG/C时会产生部分抑制,当Donor DNA预“夹板”RNA所形成的第1和第2个碱基对都是dC/G或dG/C碱基对时,酶活性会被更进一步被抑制。5'磷酸化的Donor DNA的第一个碱基为dA或dT时连接效率较高;3'端羟基化的Acceptor DNA的第一个碱基为dT时连接效率较高。
该酶对于通过RNA“夹板”介导固定的DNA底物具有比T4 DNA ligase更强的亲和力(Km = ~1nM),和随后的PCR、qPCR或滚环扩增(rolling circle amplification)等技术相结合,能够实现在复杂的混合物中超高灵敏度检测到低于纳摩尔级的特定目标RNA。PBCV-1 DNA Ligase的这种活性使得该酶可以用于包括各种SNP的miRNA、mRNA和非编码RNA的定性或定量检测,以及用于二代测序(next-generation sequencing)和分子诊断(molecular diagnostics)。
PBCV-1 DNA Ligase对ATP的浓度要求比较宽泛,ATP浓度为10µM-1mM时都可以有效发挥作用;对pH的耐受也比较高,在pH6.5-pH9的范围内都能很好发挥作用。通常,当Mg2+的浓度大于5mM、pH在7.5-8.0之间时,PBCV-1 DNA Ligase具有较高的活性。该酶的活性可以通过提高反应温度至37℃,补充5mM Mn2+而得以增强;但当反应体系中的盐离子浓度超过100mM时,该酶活性即被抑制。